GMER è attualmente uno degli scanner antirootkit più utilizzati per l’individuazione e la rimozione di rootkit dai sistemi Windows. È spesso necessario effettuare scansioni antirootkit con software quali GMER perché gran parte degli attuali software antivirus non include tecnologie per l’individuazione di questa particolare minaccia, molto differente dalle classiche infezioni da worm, trojan, backdoor o comuni virus. GMER evidenzia la presenza di eventuali rootkit sul sistema in uso. Precisamente va alla ricerca di processi, thread, moduli, servizi, file, chiavi del registro, driver ed altri elementi che risultino nascosti e quindi molto sospetti
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